More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2584 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2584  inner-membrane translocator  100 
 
 		 338 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  56.07 
 
 		 322 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  55.18 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55.18 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  53.31 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  54.6 
 
 		 334 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  54.82 
 
 		 339 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  45.88 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  44.85 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  45.14 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  45.14 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  45.14 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  46.95 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.98 
 
 		 350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  43.43 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  44.25 
 
 		 323 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  47.06 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  47.06 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  46.71 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  42.81 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  46.37 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  46.71 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.63 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  43.64 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 311 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 311 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  43.21 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.21 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.86 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  48.1 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41.67 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  41.12 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.16 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.16 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.2 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  43.14 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  46.71 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  46.71 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  46.71 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  46.71 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  46.71 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  46.71 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  46.71 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.68 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  40.68 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  41.9 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  38.62 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  41.98 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  40 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  41.16 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.76 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  38.17 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  40.97 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  41.49 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  44.06 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  43.84 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.98 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>