More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0610 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0610  inner-membrane translocator  100 
 
 		 358 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4016  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.73 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  29.38 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.29 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  31.42 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.33 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.99 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.47 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.7 
 
 		 322 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 376 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29.47 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.21 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.68 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.23 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.56 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.56 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.23 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  28.99 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.04 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.8 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  29.19 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  29.27 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.72 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  28.44 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.29 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  31.71 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  33.89 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  31.71 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  35.29 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  31.18 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  29.68 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.54 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  29.89 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  31.03 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  31.83 
 
 		 861 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  31.85 
 
 		 313 aa  123  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 324 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  31.45 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  35.1 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  31.09 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  33.24 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4655  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  30.22 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  34.53 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  35.1 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.2 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  35.1 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  35.1 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  35.1 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>