More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1671 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
306 aa  590  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  81.05 
 
 
306 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  58.96 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 
308 aa  332  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 
308 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  58.19 
 
 
309 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 
308 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  58.67 
 
 
311 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  58.69 
 
 
315 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  57.19 
 
 
309 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  56.68 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  58.8 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  57.43 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  56.82 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  56.95 
 
 
318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  56.04 
 
 
306 aa  302  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.48 
 
 
336 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  52.92 
 
 
316 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 
310 aa  299  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  53.11 
 
 
309 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 
311 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  50.31 
 
 
324 aa  289  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  54.67 
 
 
310 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  55.05 
 
 
311 aa  288  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  54.61 
 
 
311 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  54.31 
 
 
313 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  52.53 
 
 
337 aa  285  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 
317 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.82 
 
 
311 aa  279  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  53.36 
 
 
307 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 
308 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 
308 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 
308 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  53.67 
 
 
310 aa  275  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
312 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 
366 aa  251  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  46.37 
 
 
328 aa  251  9.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.63 
 
 
308 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
311 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 
310 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  42.66 
 
 
318 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  44.33 
 
 
299 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 
308 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 
308 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 
310 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 
306 aa  205  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  38.57 
 
 
297 aa  205  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 
306 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  36.96 
 
 
314 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 
302 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 
306 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 
317 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  40.6 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
314 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  44 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 
310 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 
320 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 
302 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
311 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.16 
 
 
307 aa  198  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
312 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  39.13 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.68 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 
310 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 
315 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 
315 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 
315 aa  195  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 
315 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 
315 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.39 
 
 
315 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  35.31 
 
 
314 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 
318 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 
312 aa  195  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  35.31 
 
 
314 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.06 
 
 
315 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.06 
 
 
315 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>