More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0373 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  90.38 
 
 		 277 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  61.88 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  54.62 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  59.11 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  49.81 
 
 		 291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  51.38 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  50.98 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  50 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  65.38 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  45.04 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.28 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  26.74 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  31.86 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  36.87 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.01 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  31.28 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  27.96 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  27.04 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.59 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  28.33 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>