More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1594 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
359 aa  741    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  62.64 
 
 
357 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  59.03 
 
 
391 aa  458  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  55.87 
 
 
362 aa  424  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  55.34 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  52.42 
 
 
362 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  52.96 
 
 
360 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  51.39 
 
 
335 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  49.85 
 
 
335 aa  339  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  44.28 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  44.04 
 
 
342 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  42.05 
 
 
391 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  44.21 
 
 
338 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  43.43 
 
 
342 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  42.9 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  41.79 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  41.19 
 
 
336 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  37.72 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 
327 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  29.41 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.26 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
328 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
344 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  22.05 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  22.9 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.99 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.59 
 
 
331 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 
384 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.59 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  22.44 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  28.1 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 
384 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  22.38 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  26.74 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  23.85 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  24.06 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.52 
 
 
349 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 
358 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 
358 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  23.11 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.4 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  22.02 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.4 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  22.7 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  22.95 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 
366 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  27.06 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  24.07 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  24.88 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.4 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
345 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2532  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
385 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.63 
 
 
329 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  23.73 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
326 aa  53.1  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>