More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4252 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4252  response regulator receiver protein  100 
 
 
151 aa  296  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.824205  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
660 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
653 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 
663 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  48.67 
 
 
523 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.11 
 
 
663 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
497 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.52 
 
 
647 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
553 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  42.86 
 
 
525 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.24 
 
 
529 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.2 
 
 
538 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  43.8 
 
 
547 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 
331 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  37.19 
 
 
123 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
124 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  37.1 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  36.3 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 
385 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 
223 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  36.92 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  36.92 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
121 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 
229 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 
230 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
721 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  42.54 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.5 
 
 
1956 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.19 
 
 
237 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 
272 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  31.62 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  42.28 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 
233 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 
270 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1170  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 
220 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 
260 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.63 
 
 
340 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  31.9 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  41.54 
 
 
241 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.72 
 
 
234 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  41.54 
 
 
241 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.09 
 
 
310 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  35.83 
 
 
1989 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.1 
 
 
313 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 
230 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  45.28 
 
 
229 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  35.38 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  37.61 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 
225 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 
243 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  39.06 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  35.51 
 
 
561 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
2012 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  37.7 
 
 
1374 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.51 
 
 
1960 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
2009 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  35.94 
 
 
227 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  37.6 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  34.75 
 
 
659 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  37.6 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
962 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.86 
 
 
300 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  37.6 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  39.13 
 
 
279 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  38.28 
 
 
265 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
328 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  38.28 
 
 
265 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  39.71 
 
 
556 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  37.31 
 
 
229 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 
259 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>