230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0624 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 
368 aa  713    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  85.44 
 
 
367 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  84.84 
 
 
364 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  84.52 
 
 
369 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  33.54 
 
 
331 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  33.03 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  32.31 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  29.26 
 
 
663 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  31.13 
 
 
317 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  35.31 
 
 
321 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  31.58 
 
 
344 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  32.11 
 
 
319 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  35 
 
 
321 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  30.19 
 
 
326 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  31.85 
 
 
329 aa  99.4  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.85 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  30.2 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  31.29 
 
 
326 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  30.99 
 
 
663 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  30.45 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  28.57 
 
 
675 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  31.73 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  29.39 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  31.76 
 
 
343 aa  89.7  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  28.75 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  29.45 
 
 
687 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  30.1 
 
 
322 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  30.86 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  28.92 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  28 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  30.72 
 
 
683 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  28.75 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  29.49 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  30.19 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  29.49 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  29.49 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  27.27 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  29.77 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  26.73 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  32.72 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.09 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.89 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  34.84 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.92 
 
 
326 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  30.37 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.26 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.39 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.08 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  34.29 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  34.29 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.55 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  25.62 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  25.62 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.22 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  34.5 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.73 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  25.81 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  24.68 
 
 
320 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.39 
 
 
322 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  24.68 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  25.82 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  32.94 
 
 
313 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.28 
 
 
327 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.99 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  27.52 
 
 
229 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  32.97 
 
 
354 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  28.81 
 
 
327 aa  59.7  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.63 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.56 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.5 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  31.98 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.29 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  25.31 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  26.01 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.43 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  30.69 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.71 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  24.17 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  25.39 
 
 
332 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.85 
 
 
312 aa  56.2  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  41.03 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  28.1 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  29.69 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.37 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.84 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.95 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  39.66 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.52 
 
 
299 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.82 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  26.84 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  22.63 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5791  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.36 
 
 
339 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  37.21 
 
 
334 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>