More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1791 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1791  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.210194  hitchhiker  0.00588417 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0176  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.67 
 
 
334 aa  125  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.610666  normal  0.201691 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  35.86 
 
 
514 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  36.36 
 
 
376 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  37.11 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.43 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  35.46 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  34.69 
 
 
496 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  28.9 
 
 
487 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  34.48 
 
 
501 aa  82  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  34.46 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  30.94 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  34.01 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  37.93 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  34 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  34.81 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  33.33 
 
 
516 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  33.52 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  33.78 
 
 
503 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  34.04 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  34.04 
 
 
493 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  33.52 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  33.52 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  33.52 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  33.52 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  29.32 
 
 
520 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  33.52 
 
 
485 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  33.57 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  33.78 
 
 
503 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  31.97 
 
 
500 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  33.52 
 
 
461 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  33.52 
 
 
485 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  33.78 
 
 
501 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  34.75 
 
 
524 aa  79  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  32.65 
 
 
511 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  36.42 
 
 
499 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  34.18 
 
 
376 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  32.65 
 
 
511 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  33.88 
 
 
501 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  32.65 
 
 
511 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  36.42 
 
 
499 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  32.94 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  33.53 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  36.84 
 
 
490 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  36.84 
 
 
500 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  36.84 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  36.48 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  34.27 
 
 
537 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  36.84 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.62 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  31.97 
 
 
501 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  36.84 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  32.43 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  29.59 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  32.79 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  30.6 
 
 
473 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  32.87 
 
 
471 aa  77  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  32.79 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  33.33 
 
 
458 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  34.19 
 
 
505 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  33.54 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  30.43 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.33 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  32.89 
 
 
510 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  33.33 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  32.78 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  34.46 
 
 
507 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  34.18 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  34.25 
 
 
462 aa  75.9  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  35.14 
 
 
502 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  33.33 
 
 
496 aa  75.5  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  34.18 
 
 
381 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  31.03 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  33.56 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  33.33 
 
 
492 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  33.12 
 
 
408 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  33.12 
 
 
408 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  30.43 
 
 
377 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  32.43 
 
 
504 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  29.28 
 
 
391 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  35.62 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  35.42 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  31.54 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  33.33 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  33.72 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  35.42 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  34.87 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  34.27 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  30.82 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  32 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  33.1 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  33.78 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  34.23 
 
 
527 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>