More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1751 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.82 
 
 		 668 aa  656    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  52.28 
 
 		 654 aa  667    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 678 aa  1400    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  50.31 
 
 		 751 aa  647    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.47 
 
 		 662 aa  655    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  57.19 
 
 		 672 aa  808    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  52.25 
 
 		 684 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  50.22 
 
 		 684 aa  635  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  49.7 
 
 		 682 aa  633  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.92 
 
 		 647 aa  631  1e-179  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  48.02 
 
 		 710 aa  600  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  44.78 
 
 		 701 aa  580  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  38.79 
 
 		 679 aa  432  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  32.48 
 
 		 712 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  31.19 
 
 		 749 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.66 
 
 		 731 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  32.73 
 
 		 748 aa  241  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.24 
 
 		 822 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  31.46 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.38 
 
 		 639 aa  237  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  31.12 
 
 		 652 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.87 
 
 		 736 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.29 
 
 		 726 aa  230  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  31.73 
 
 		 776 aa  229  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.6 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  30.78 
 
 		 1224 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  31.42 
 
 		 749 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.27 
 
 		 841 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  30.03 
 
 		 729 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  30.63 
 
 		 785 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  29.34 
 
 		 768 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  29.34 
 
 		 768 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.34 
 
 		 732 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.75 
 
 		 743 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  31.62 
 
 		 1320 aa  223  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  31.01 
 
 		 1240 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  30.87 
 
 		 750 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  30.66 
 
 		 741 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  30.56 
 
 		 727 aa  221  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.61 
 
 		 746 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  29.91 
 
 		 748 aa  220  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.23 
 
 		 839 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  30.9 
 
 		 737 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.65 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.63 
 
 		 732 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.46 
 
 		 668 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.05 
 
 		 957 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  30.13 
 
 		 812 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  30.76 
 
 		 731 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.52 
 
 		 754 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.63 
 
 		 1217 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  29.84 
 
 		 716 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  30.22 
 
 		 759 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  30.22 
 
 		 759 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.13 
 
 		 659 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  30.43 
 
 		 677 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.7 
 
 		 654 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  30.22 
 
 		 759 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.38 
 
 		 747 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.58 
 
 		 731 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.84 
 
 		 785 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  30.54 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  29.15 
 
 		 742 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.67 
 
 		 633 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.62 
 
 		 636 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.3 
 
 		 729 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  28.94 
 
 		 741 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  30.69 
 
 		 648 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  36.86 
 
 		 722 aa  213  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  30.54 
 
 		 732 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.49 
 
 		 721 aa  213  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.11 
 
 		 736 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  29.58 
 
 		 740 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  29.52 
 
 		 716 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  30.17 
 
 		 732 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.54 
 
 		 741 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  30.41 
 
 		 640 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  35.62 
 
 		 765 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  35.67 
 
 		 740 aa  210  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  34.99 
 
 		 740 aa  210  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  28.41 
 
 		 634 aa  210  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  35.01 
 
 		 736 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  27.55 
 
 		 729 aa  210  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  29.54 
 
 		 736 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  29.82 
 
 		 736 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  29.82 
 
 		 736 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  28.64 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  30.24 
 
 		 755 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  30.3 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.8 
 
 		 621 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  28.21 
 
 		 725 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  28.98 
 
 		 735 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.1 
 
 		 741 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  27.99 
 
 		 659 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.97 
 
 		 721 aa  207  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.47 
 
 		 768 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.51 
 
 		 784 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.12 
 
 		 646 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.53 
 
 		 742 aa  207  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  30.19 
 
 		 725 aa  206  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>