More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1237 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1237  excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 498 aa  1035    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.173931  normal  0.435946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1156  excinuclease ABC subunit C  40.97 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4113  excinuclease ABC C subunit domain protein  37.59 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1011  excinuclease ABC, C subunit  33.81 
 
 		 479 aa  243  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0197  excinuclease ABC subunit C  32.07 
 
 		 437 aa  203  6e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 		 607 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 624 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42 
 
 		 607 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.49 
 
 		 588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  38.68 
 
 		 607 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  38.68 
 
 		 607 aa  187  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  43.22 
 
 		 613 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 666 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 656 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 692 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.97 
 
 		 685 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  42.56 
 
 		 520 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  46.32 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  39.29 
 
 		 644 aa  177  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  37.79 
 
 		 684 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 		 604 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  40.79 
 
 		 599 aa  174  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.42 
 
 		 611 aa  173  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  40.8 
 
 		 737 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 658 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  39.91 
 
 		 596 aa  170  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.2 
 
 		 601 aa  170  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  37.05 
 
 		 649 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  40.79 
 
 		 602 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  39.37 
 
 		 647 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 628 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  40.24 
 
 		 682 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  38.49 
 
 		 693 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  38.63 
 
 		 705 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  40.6 
 
 		 666 aa  164  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 		 527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 676 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 676 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  42.4 
 
 		 620 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 676 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  34.74 
 
 		 619 aa  163  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 613 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  42.4 
 
 		 620 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 596 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  44.86 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 		 627 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  39.32 
 
 		 629 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  41.33 
 
 		 677 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  31.53 
 
 		 597 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 		 638 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 598 aa  160  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 		 652 aa  160  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  42.99 
 
 		 591 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 527 aa  160  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  34.7 
 
 		 640 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 644 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  34.7 
 
 		 640 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  38.63 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  36.19 
 
 		 679 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 526 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 613 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 		 613 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  37.65 
 
 		 614 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.01 
 
 		 671 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  39 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.48 
 
 		 653 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  42.52 
 
 		 596 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 631 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  40.62 
 
 		 627 aa  156  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  33.66 
 
 		 674 aa  156  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 628 aa  156  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 624 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  36.03 
 
 		 690 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  42.78 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 		 616 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  36.76 
 
 		 596 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  35.55 
 
 		 649 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  35.79 
 
 		 669 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.38 
 
 		 665 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 650 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  39.73 
 
 		 610 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  33.57 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  40.47 
 
 		 687 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  41.67 
 
 		 641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  32.96 
 
 		 598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  37.02 
 
 		 675 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  35.09 
 
 		 678 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 519 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  36.65 
 
 		 663 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  40.65 
 
 		 594 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 593 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  40.65 
 
 		 594 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  39.91 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  40.65 
 
 		 594 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  33.85 
 
 		 641 aa  154  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  36.54 
 
 		 617 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 625 aa  153  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>