83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0456 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  44.44 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  44.19 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  42.97 
 
 		 131 aa  87  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  40.34 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  36.43 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  47.67 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  37.04 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  31.2 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  31.2 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  31.2 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  34.53 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  40.16 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  31.71 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  38.58 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.61 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  34.53 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  36.92 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  32 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  38.71 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  34.33 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.13 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  33.08 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.34 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  33.83 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.51 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  34.31 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  33.83 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  34.38 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  33.58 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  30.58 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  34.35 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.59 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  33.07 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.39 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  33.93 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  33.59 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  32.94 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  33.06 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  39.02 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  30.53 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.64 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  32.35 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  29.03 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  29.77 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  30.43 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  32.81 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.1 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  36.94 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0983  DoxX family protein  29.51 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382706  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  36.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  35.87 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  31.45 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  32.86 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  32.86 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.47 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  32.86 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  31.16 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  29.77 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  31.29 
 
 		 378 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  30.58 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  29.01 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  29.01 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.34 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  36.84 
 
 		 143 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  28.4 
 
 		 186 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  32.26 
 
 		 140 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  29.01 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  29.66 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  28.68 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.94 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  40 
 
 		 216 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  38.2 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.34 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  32.37 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.51 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  38.57 
 
 		 189 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>