71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5912 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  100 
 
 		 331 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  51.08 
 
 		 219 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  53.96 
 
 		 162 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  48.92 
 
 		 174 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  51.43 
 
 		 161 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  51.43 
 
 		 161 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  51.43 
 
 		 161 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  48.89 
 
 		 162 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  48.89 
 
 		 214 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  51.18 
 
 		 175 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  47.86 
 
 		 191 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  45.64 
 
 		 169 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  45.22 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  47.62 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  40.34 
 
 		 193 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  42.51 
 
 		 269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  40.34 
 
 		 174 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  48.15 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  44.44 
 
 		 173 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  44.52 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  50.39 
 
 		 170 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  40.6 
 
 		 139 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  41.91 
 
 		 211 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  42.38 
 
 		 254 aa  86.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  46.04 
 
 		 177 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  44.44 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.48 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.93 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  36.52 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  40.48 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  28.72 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  34.07 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  33.53 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  30.47 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  35.24 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  28.39 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  27.96 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  33.63 
 
 		 424 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  30.15 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  28.76 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  32.46 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  26.61 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  31.61 
 
 		 597 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  26.61 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  30.48 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  35.58 
 
 		 464 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  29.91 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  32.41 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  34.25 
 
 		 240 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  38.55 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4265  hypothetical protein  67.92 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00390671  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  31.52 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  31.36 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  28.31 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2507  lipoprotein  25.74 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  29.36 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  38.64 
 
 		 975 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  31.16 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.69 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4835  hypothetical protein  43.55 
 
 		 1168 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.391306  decreased coverage  0.000518688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  25.37 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  30.11 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  30.11 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  31.25 
 
 		 610 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  29.7 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  35.4 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  35.4 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  35.4 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  35.4 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  34.62 
 
 		 569 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>