31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4265 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4265  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00390671  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2250  hypothetical protein  36.52 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6705  hypothetical protein  32.13 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  29.43 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 		 267 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  44.07 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2301  hypothetical protein  28.21 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1612 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4142  hypothetical protein  29.46 
 
 		 272 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5651  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  42.62 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  40.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  40.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  40.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  40.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  40.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  40.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  40.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 998 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.31 
 
 		 641 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  41.94 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  28.07 
 
 		 684 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4835  hypothetical protein  37.88 
 
 		 1168 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.391306  decreased coverage  0.000518688 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  39.71 
 
 		 497 aa  43.9  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  28.84 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.49 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  27.67 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5402  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  40.74 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5109  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  40.74 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5021  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  40.74 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  41.07 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  32.47 
 
 		 224 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>