More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5546 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 264 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  63.16 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  53.21 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  51.19 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  51.19 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  51.19 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  50 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  45.63 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  45.63 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  38.29 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.13 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.1 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.21 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.17 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  31.32 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.93 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.22 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.56 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  33.1 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.62 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.99 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.43 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.85 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.18 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  26.6 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.22 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  30.18 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.83 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.82 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.89 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.26 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.1 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.17 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.46 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  31.02 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>