More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2104 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  100 
 
 		 430 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  64.25 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  63.72 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  64.71 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  63.77 
 
 		 431 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  63.85 
 
 		 443 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  60 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  62.59 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  63.06 
 
 		 436 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  58.16 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  53.12 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  37.83 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  37.94 
 
 		 446 aa  262  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  36.25 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.21 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  38.35 
 
 		 448 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  36.92 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.32 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  36.18 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  35.73 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.03 
 
 		 396 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  35.36 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.33 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.97 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.96 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  39.67 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.17 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  34.69 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  37.37 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.81 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 		 458 aa  222  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  33.03 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  36.15 
 
 		 978 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  39.75 
 
 		 402 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  39.75 
 
 		 402 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.96 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.52 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  31.97 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  32.35 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.28 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  39.75 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 478 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.61 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  35.03 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.48 
 
 		 401 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  35.08 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  34.83 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  36.12 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  35.45 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  34.13 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  34.1 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  29.81 
 
 		 479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  38.1 
 
 		 400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  35.21 
 
 		 427 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  36.56 
 
 		 430 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  36.41 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  34.83 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  33.02 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.59 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  34.49 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  35.48 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  36.67 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  29.58 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  34.6 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  36.14 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  34.35 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  33.91 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  32.35 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  34.04 
 
 		 476 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  34.78 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.43 
 
 		 396 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  33.94 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  32.8 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.93 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  38.19 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  31.13 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  31.13 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  36.9 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  34.1 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  30.91 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  32.49 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  30.91 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  31.13 
 
 		 450 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  31.43 
 
 		 450 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.67 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.45 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  36.45 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  30.91 
 
 		 450 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>