61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2670 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  85.26 
 
 		 476 aa  805    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  100 
 
 		 476 aa  949    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  86.55 
 
 		 476 aa  828    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  60.78 
 
 		 475 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  58.58 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  60.27 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  57.52 
 
 		 475 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  45.34 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  42.76 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  43.93 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  45.75 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  41.79 
 
 		 498 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  44.34 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  44.34 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  45.75 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  45.52 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  41.36 
 
 		 477 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  42.86 
 
 		 479 aa  319  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  42.73 
 
 		 501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  44.4 
 
 		 536 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  42.83 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  41.89 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  41.89 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  44.14 
 
 		 512 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  42.59 
 
 		 466 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  43.8 
 
 		 523 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  41.39 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  42.4 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  39.46 
 
 		 482 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  40.35 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  40.35 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  35.51 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  38.53 
 
 		 477 aa  229  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  39.32 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  33.96 
 
 		 485 aa  226  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  33.12 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  33.48 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  33.62 
 
 		 475 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  33.64 
 
 		 475 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  33.1 
 
 		 543 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  32.33 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  32.89 
 
 		 483 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  31.72 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  31.93 
 
 		 488 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.36 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  30.53 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  32.76 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  34.2 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  30.57 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  30.99 
 
 		 399 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  35.97 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 		 547 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  29.75 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.74 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.49 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.7 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.75 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.72 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.28 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>