115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1417 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  89.74 
 
 		 760 aa  1401    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  70.48 
 
 		 752 aa  1045    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  96.71 
 
 		 768 aa  1492    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  97.23 
 
 		 759 aa  1503    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  80.13 
 
 		 759 aa  1256    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  80.92 
 
 		 759 aa  1262    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  71 
 
 		 749 aa  1068    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  86.81 
 
 		 757 aa  1362    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  58.89 
 
 		 788 aa  818    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  97.1 
 
 		 759 aa  1500    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 759 aa  1565    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  90.75 
 
 		 756 aa  1399    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  91.29 
 
 		 757 aa  1410    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  70.73 
 
 		 749 aa  1066    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  95.52 
 
 		 759 aa  1483    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  95.96 
 
 		 600 aa  1159    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  90.49 
 
 		 756 aa  1395    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  87.19 
 
 		 756 aa  1345    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1098 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  27.48 
 
 		 1116 aa  213  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  26.73 
 
 		 861 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  29.5 
 
 		 562 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  31 
 
 		 802 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  28.82 
 
 		 502 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  25.06 
 
 		 597 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1118 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  25.36 
 
 		 1113 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  24.38 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  25.48 
 
 		 1117 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.55 
 
 		 918 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.55 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  21.61 
 
 		 970 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.77 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  25.2 
 
 		 872 aa  58.9  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  22.1 
 
 		 821 aa  57.4  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.2 
 
 		 1091 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  24.87 
 
 		 991 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  22.16 
 
 		 1108 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.8 
 
 		 1104 aa  56.6  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  22.09 
 
 		 467 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  22.83 
 
 		 1100 aa  55.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  31.76 
 
 		 235 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  30.2 
 
 		 918 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  21.15 
 
 		 1086 aa  54.7  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  21.19 
 
 		 1178 aa  54.3  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  24.32 
 
 		 901 aa  54.3  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  23.1 
 
 		 1134 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  22.85 
 
 		 773 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.53 
 
 		 918 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  22.85 
 
 		 663 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 918 aa  52  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.47 
 
 		 1194 aa  50.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  24.02 
 
 		 988 aa  50.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  22.67 
 
 		 1006 aa  50.8  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  21.3 
 
 		 1120 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  32.48 
 
 		 1904 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  22.14 
 
 		 458 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  24.5 
 
 		 899 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  23.47 
 
 		 589 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  23.12 
 
 		 1086 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  24.15 
 
 		 892 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  29.93 
 
 		 918 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  29.93 
 
 		 918 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  29.93 
 
 		 918 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 727 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 918 aa  49.3  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  20.14 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  29.93 
 
 		 918 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.93 
 
 		 918 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  22.97 
 
 		 980 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.95 
 
 		 1102 aa  48.9  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  30.41 
 
 		 918 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 		 1002 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  30.41 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  23.27 
 
 		 876 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.25 
 
 		 1155 aa  47.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  22.03 
 
 		 1120 aa  47.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  26.61 
 
 		 1045 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  25.63 
 
 		 746 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  19.85 
 
 		 1222 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  26.12 
 
 		 1161 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  32.63 
 
 		 535 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  24.82 
 
 		 1093 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  24.06 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  22.14 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  22.17 
 
 		 1150 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 448 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  20.16 
 
 		 1113 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  25.83 
 
 		 1064 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  20.16 
 
 		 1113 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  25.17 
 
 		 1064 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  25.53 
 
 		 939 aa  45.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 641 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  20.68 
 
 		 584 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  25.17 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  25.17 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  25.17 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  25.17 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  25.17 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.61 
 
 		 933 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>