More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0651 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0651  response regulator receiver protein  100 
 
 
138 aa  277  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0630  response regulator receiver protein  99.19 
 
 
123 aa  246  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3992  response regulator receiver protein  66.94 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383415  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3827  response regulator receiver protein  66.67 
 
 
122 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.16634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  39.2 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  42.48 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
887 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
1011 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
727 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
845 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
899 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
727 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
845 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
685 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.53 
 
 
457 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.29 
 
 
515 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  34.15 
 
 
236 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
815 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.4 
 
 
497 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
600 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.53 
 
 
457 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
462 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  34.11 
 
 
558 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3419  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.96 
 
 
475 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0592604  normal  0.514799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  32.17 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.95 
 
 
457 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.95 
 
 
457 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
759 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0137592  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2343  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.96 
 
 
475 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
727 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
807 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  27.48 
 
 
226 aa  62  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
640 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
781 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
662 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.93 
 
 
457 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
785 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
526 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
1059 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
732 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.26 
 
 
465 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
943 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1657  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.29 
 
 
456 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0365007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 
194 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  34.15 
 
 
685 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  30.56 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
732 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
925 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  38.58 
 
 
632 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
837 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
705 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  38.58 
 
 
632 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29000  sigma54-dependent response regulator, two-component  38.74 
 
 
472 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.99042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  30.08 
 
 
566 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  35.19 
 
 
458 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.71 
 
 
1015 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 
211 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
1014 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 
211 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.44 
 
 
456 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  35.78 
 
 
733 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
361 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
794 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.51 
 
 
458 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12736  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 
226 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  37.04 
 
 
454 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1426 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 
225 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
789 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
789 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  32.73 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  37.8 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
888 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  32.12 
 
 
210 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
375 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2518  two-component transcriptional regulator  33.63 
 
 
246 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
630 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  31.75 
 
 
245 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
704 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1394  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 
450 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.205793  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  35.96 
 
 
1164 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.04 
 
 
458 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1164 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2914  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.17 
 
 
459 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  35.88 
 
 
768 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3137  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 
242 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
641 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1415 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2521  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.07 
 
 
475 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0633509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 
245 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
585 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.43 
 
 
458 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2268  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 
221 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1076 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
581 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>