277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0222 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  74.23 
 
 		 260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  72.8 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  72.31 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  70.38 
 
 		 260 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  71.92 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  73.36 
 
 		 260 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  72.97 
 
 		 264 aa  370  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  71.04 
 
 		 260 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  67.45 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  67.45 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  67.84 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  68.24 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  66.93 
 
 		 260 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.77 
 
 		 261 aa  344  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.31 
 
 		 260 aa  334  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.07 
 
 		 263 aa  333  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.93 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.15 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.54 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  62.99 
 
 		 265 aa  326  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  67.43 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  57.03 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.44 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.25 
 
 		 257 aa  272  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.83 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.2 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.82 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.26 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.81 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.18 
 
 		 259 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.22 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  49.41 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  47.13 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.95 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.88 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.71 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  44.66 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.28 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.02 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  46.95 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.45 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.49 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.04 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.22 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.24 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  45.99 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.23 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.75 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.8 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.92 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.45 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.24 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.86 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.32 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.45 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  41.98 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.3 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  49.57 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.64 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.6 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.53 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  47.28 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.7 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.7 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.2 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.08 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.7 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.53 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  41.76 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.31 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.92 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  46.44 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  41.31 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  42.06 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.3 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.29 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  41.73 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.24 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  48 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  41.73 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  48.2 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.28 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.28 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.66 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.71 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.71 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.53 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.68 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.18 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  41.9 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.18 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.11 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.98 
 
 		 274 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.08 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.66 
 
 		 268 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.13 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>