More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3824 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3824  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 235 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3965  DNA repair protein RadC  99.15 
 
 		 235 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.207152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3887  DNA repair protein RadC  95.74 
 
 		 235 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3935  DNA repair protein RadC  74.53 
 
 		 222 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3937  DNA repair protein RadC  71.7 
 
 		 222 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.040495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1122  DNA repair protein RadC  64.29 
 
 		 223 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3262  DNA repair protein RadC  66.98 
 
 		 203 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3938  DNA repair protein RadC  84 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0199142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  46.3 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  44.54 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  44.19 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  42.58 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  43.06 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  42.4 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 222 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  30.09 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  38.7 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  44.34 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  37.73 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  36.79 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  34.11 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  32.37 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  35.94 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0491  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  34.75 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  36.15 
 
 		 222 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  41.94 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  43.6 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  35 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  34.88 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  32.57 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  31.48 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  28.37 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  31.19 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  33.97 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  31.78 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  31.05 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  34.29 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  33.96 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  32.35 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1834  DNA repair protein RadC  37.91 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  31.46 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2119  DNA repair protein RadC  37.91 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  32.57 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>