More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0984 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0984  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  273  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1045  response regulator receiver protein  80.58 
 
 		 138 aa  199  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3631  response regulator receiver protein  72.41 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.222558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0609  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0634  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0643  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0398  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4173  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0653  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0268585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1641  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.43 
 
 		 704 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 531 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 317 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.43 
 
 		 704 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.13 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 2137 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 1002 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 917 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 383 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  36.79 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 917 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.5 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 386 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  36.79 
 
 		 436 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 381 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.7 
 
 		 917 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  34.35 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  35.29 
 
 		 356 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 255 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 233 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 233 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 228 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  33.86 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  33.6 
 
 		 705 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.7 
 
 		 917 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  36.27 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1744  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.05 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  32.81 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 922 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0616  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0641  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0650  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 633 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1127 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 1758 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 932 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  32.38 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  34.58 
 
 		 1888 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  33.83 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0660  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  32.35 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>