More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2149 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  57.08 
 
 
223 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  52.97 
 
 
300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  53.07 
 
 
229 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  48.58 
 
 
225 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.97 
 
 
532 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.18 
 
 
517 aa  178  7e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.27 
 
 
531 aa  177  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
518 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  45.25 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  44.72 
 
 
532 aa  172  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.99 
 
 
526 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.99 
 
 
530 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.99 
 
 
530 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.99 
 
 
528 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  43.9 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  43.33 
 
 
209 aa  164  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  43.9 
 
 
258 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  46.11 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  43.9 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  34.91 
 
 
542 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  42.63 
 
 
551 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  43.41 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  42.44 
 
 
255 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  40.96 
 
 
556 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  43.69 
 
 
255 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  43.69 
 
 
255 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  43.69 
 
 
255 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  43.69 
 
 
255 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  43.69 
 
 
255 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  42.23 
 
 
213 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 
554 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 
554 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  35.35 
 
 
514 aa  158  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  39.62 
 
 
537 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  39.52 
 
 
583 aa  157  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
558 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
558 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
558 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
558 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
558 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
558 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
558 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.24 
 
 
553 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  39.9 
 
 
547 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40 
 
 
567 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  39.25 
 
 
536 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  40.62 
 
 
231 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  43.2 
 
 
255 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  38.74 
 
 
562 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
567 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.19 
 
 
550 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.58 
 
 
557 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.63 
 
 
553 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  37.14 
 
 
530 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  37.74 
 
 
528 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  41.31 
 
 
515 aa  154  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.97 
 
 
560 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.97 
 
 
560 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  38.79 
 
 
552 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  40.2 
 
 
545 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.65 
 
 
555 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.97 
 
 
560 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.97 
 
 
560 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.15 
 
 
541 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  43.78 
 
 
544 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 
554 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 
554 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  44.32 
 
 
542 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.44 
 
 
581 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 
552 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 
552 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 
553 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 
536 aa  152  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
552 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
552 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.45 
 
 
575 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  42.56 
 
 
544 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  41.67 
 
 
543 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  36.65 
 
 
553 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  44.62 
 
 
541 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 
557 aa  151  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  42.7 
 
 
545 aa  151  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.27 
 
 
560 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  41.67 
 
 
252 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  44.09 
 
 
541 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  44.09 
 
 
541 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  44.09 
 
 
541 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  44.09 
 
 
541 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.9 
 
 
600 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  43.24 
 
 
541 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.24 
 
 
555 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  44.09 
 
 
541 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  43.24 
 
 
542 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  40.93 
 
 
557 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  43.19 
 
 
254 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.5 
 
 
557 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  39.49 
 
 
566 aa  148  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  43.55 
 
 
541 aa  148  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  43.24 
 
 
541 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>