More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3765 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 		 217 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  29.38 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 216 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 237 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 209 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  30.63 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  30.18 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  28.31 
 
 		 242 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 212 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  25.82 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 		 213 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 221 aa  99.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 239 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  29.77 
 
 		 206 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 213 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 218 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 217 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  28.9 
 
 		 217 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 212 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 250 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 228 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.01 
 
 		 216 aa  95.5  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  27.44 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 223 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.19 
 
 		 212 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 209 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 224 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 220 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 239 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.81 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  24.4 
 
 		 597 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.7 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.85 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.12 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_002936  DET1144  DNA-binding response regulator  29.49 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.76 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.76 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.92 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.51 
 
 		 217 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 217 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  29.19 
 
 		 213 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 250 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 214 aa  89  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 219 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 219 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 219 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 219 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  26.67 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 222 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.07 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 227 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>