287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3734 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3734  response regulator receiver protein  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2462  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2525  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  36.36 
 
 		 685 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  35.65 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 1134 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3236  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 725 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0939  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 135 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383078  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1934  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1079 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 758 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 1106 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 534 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 819 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 773 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5758  histidine kinase  36.84 
 
 		 472 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.94 
 
 		 1408 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 126 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 857 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 803 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 691 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0393  DNA-binding response regulator  30.3 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.632289  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0327  response regulator receiver domain-containing protein  43.55 
 
 		 142 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  40 
 
 		 539 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 849 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 389 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  39.19 
 
 		 594 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 1018 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 699 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  32.93 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 456 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 456 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 845 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 880 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 643 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 551 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  42.25 
 
 		 755 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  34 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.55 
 
 		 1112 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 721 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  33.91 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 937 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 773 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  41.43 
 
 		 927 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 911 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 769 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 937 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 962 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 		 469 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 957 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.88 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1013 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 650 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  31.87 
 
 		 127 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 417 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  31.47 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1051 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0967  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 		 469 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 1102 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 897 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  36.63 
 
 		 1015 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  40 
 
 		 927 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 1646 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 		 1201 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  35.64 
 
 		 585 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 888 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 467 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.78 
 
 		 582 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 123 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 129 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  34.17 
 
 		 1561 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1124 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.77 
 
 		 769 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 766 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  36.14 
 
 		 541 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  33.06 
 
 		 892 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 719 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 622 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.77 
 
 		 769 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  36.14 
 
 		 541 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 649 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 1646 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.12 
 
 		 452 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 394 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.65 
 
 		 452 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 142 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2984  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.11 
 
 		 458 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.826768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 853 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 994 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  37.35 
 
 		 544 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.77 
 
 		 769 aa  45.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  34.45 
 
 		 903 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 777 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 997 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 468 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>