More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3443 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  100 
 
 		 556 aa  1148    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  39.66 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  37.11 
 
 		 553 aa  352  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  36.21 
 
 		 532 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  35.88 
 
 		 579 aa  310  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  35.79 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  34.19 
 
 		 556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  34.83 
 
 		 546 aa  306  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  35.42 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  34.64 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  34.11 
 
 		 552 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  34.89 
 
 		 544 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 550 aa  297  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  34.84 
 
 		 557 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  35.03 
 
 		 530 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  35.37 
 
 		 619 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.48 
 
 		 540 aa  290  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  34.39 
 
 		 548 aa  289  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  37.73 
 
 		 565 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  32.91 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.91 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.48 
 
 		 543 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 563 aa  266  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  32.1 
 
 		 539 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  36.96 
 
 		 568 aa  257  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  35.7 
 
 		 565 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 544 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  32.23 
 
 		 539 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  35.74 
 
 		 485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 547 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 520 aa  243  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.62 
 
 		 522 aa  243  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 557 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.28 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  31.46 
 
 		 562 aa  242  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  30.15 
 
 		 522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  30.15 
 
 		 522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.96 
 
 		 522 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  30.15 
 
 		 522 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  32.1 
 
 		 564 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  30.46 
 
 		 543 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  30.52 
 
 		 520 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.81 
 
 		 544 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.19 
 
 		 522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.56 
 
 		 549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 541 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  29.59 
 
 		 522 aa  233  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  31.73 
 
 		 569 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.7 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  30.02 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 537 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.84 
 
 		 569 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 522 aa  230  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.81 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.02 
 
 		 540 aa  226  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.39 
 
 		 546 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.8 
 
 		 541 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 555 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 543 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.07 
 
 		 536 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 583 aa  223  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  31.27 
 
 		 548 aa  223  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  32.32 
 
 		 606 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 584 aa  223  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 564 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.28 
 
 		 543 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  31.35 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.16 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  31 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.77 
 
 		 601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 660 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  31.1 
 
 		 550 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.42 
 
 		 542 aa  217  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 549 aa  217  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  30.98 
 
 		 612 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 589 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  30.74 
 
 		 550 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  30.92 
 
 		 659 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 526 aa  214  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 660 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 613 aa  213  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 560 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  30.8 
 
 		 612 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 616 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  31.36 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.8 
 
 		 620 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.78 
 
 		 544 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.07 
 
 		 576 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>