More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2071 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 629 aa  1296    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 620 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 639 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 650 aa  137  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.95 
 
 		 646 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 709 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 612 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.5 
 
 		 652 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  26.15 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2637  hypothetical protein  24.5 
 
 		 631 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 638 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 627 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.84 
 
 		 666 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  26.86 
 
 		 651 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  25.33 
 
 		 666 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 632 aa  97.8  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 628 aa  97.4  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 602 aa  97.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 621 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.4 
 
 		 638 aa  95.1  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 634 aa  94.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 634 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.05 
 
 		 633 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 624 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.13 
 
 		 680 aa  92  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 629 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 618 aa  90.9  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 641 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 648 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 642 aa  90.5  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  21.12 
 
 		 616 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 621 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  23.11 
 
 		 623 aa  88.6  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 602 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 628 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 655 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 623 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 634 aa  87  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.84 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2728  hypothetical protein  26.6 
 
 		 628 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000615794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3493  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 621 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.53 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.23 
 
 		 685 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  23.31 
 
 		 646 aa  84  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01529  putative orphan protein  24.68 
 
 		 624 aa  84.3  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  25.17 
 
 		 621 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  24.32 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.14 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.4 
 
 		 618 aa  80.9  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 630 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  25.78 
 
 		 685 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 657 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 713 aa  80.1  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 648 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.6 
 
 		 613 aa  77  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 680 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 619 aa  77  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 613 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  23.74 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.38 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.49 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  40.71 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23 
 
 		 656 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  34.48 
 
 		 611 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.09 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  38.17 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 642 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  39.82 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  38.17 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  38.17 
 
 		 659 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  38.17 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  38.17 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  24.92 
 
 		 611 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  38.93 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  38.93 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  38.17 
 
 		 641 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  38.17 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.46 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  38.93 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.46 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.46 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  38.93 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.46 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>