More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1505 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
414 aa  847    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  58.55 
 
 
415 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.54 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 
413 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 
419 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.3 
 
 
412 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  35.93 
 
 
414 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.6 
 
 
409 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  30.02 
 
 
418 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.47 
 
 
410 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.43 
 
 
409 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 
412 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.43 
 
 
391 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
416 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  28.74 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.08 
 
 
653 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.46 
 
 
398 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.37 
 
 
427 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 
409 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 
406 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
405 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
405 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.21 
 
 
410 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.24 
 
 
410 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  28.5 
 
 
414 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  30.22 
 
 
409 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.29 
 
 
443 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  30.47 
 
 
414 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  30.19 
 
 
394 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  30.22 
 
 
409 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  31.26 
 
 
409 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.34 
 
 
658 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  27.31 
 
 
427 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.69 
 
 
402 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.58 
 
 
407 aa  166  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  31.71 
 
 
417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
410 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  30.36 
 
 
648 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  29.1 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  29.67 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.43 
 
 
656 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  31.07 
 
 
409 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  29.67 
 
 
408 aa  162  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  31.7 
 
 
401 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 
406 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  30.27 
 
 
670 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 
406 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 
406 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  29.72 
 
 
419 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.13 
 
 
657 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 
406 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.53 
 
 
437 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  27.23 
 
 
421 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  26.15 
 
 
425 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.02 
 
 
400 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  29.25 
 
 
411 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  31.26 
 
 
668 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  31.26 
 
 
668 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.27 
 
 
400 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  30.29 
 
 
412 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 
392 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
397 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  29.15 
 
 
653 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  27.4 
 
 
414 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.55 
 
 
405 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
409 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 
416 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  30.92 
 
 
657 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
415 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.51 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.24 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  28.95 
 
 
643 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.61 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  27.32 
 
 
647 aa  152  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  28.29 
 
 
657 aa  152  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  32.41 
 
 
424 aa  152  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  28.61 
 
 
394 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 
403 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  27.86 
 
 
420 aa  151  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  32.43 
 
 
676 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.08 
 
 
394 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.72 
 
 
696 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 
416 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  28.77 
 
 
404 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  29.81 
 
 
654 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  28.77 
 
 
404 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.48 
 
 
654 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.58 
 
 
408 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  28.81 
 
 
682 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  29.93 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  26.97 
 
 
649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>