More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2071 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  100 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  70.59 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  54.89 
 
 
149 aa  133  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  46.38 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  44.78 
 
 
143 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 
296 aa  97.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  44.7 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 
188 aa  90.5  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  46.04 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  44.53 
 
 
339 aa  87.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  42.07 
 
 
192 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 
277 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  38.69 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  40.26 
 
 
296 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.96 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  40.58 
 
 
293 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  43.66 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.3 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 
294 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 
277 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  44.93 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  39.55 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  38.03 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  37.96 
 
 
317 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.16 
 
 
282 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
293 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 
289 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  40.65 
 
 
292 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  40 
 
 
324 aa  72  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  35.97 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.62 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  40.88 
 
 
310 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  37.23 
 
 
305 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  36.84 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.59 
 
 
288 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  39.46 
 
 
341 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
341 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
341 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  39.35 
 
 
303 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  38.73 
 
 
305 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 
293 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  37.96 
 
 
305 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  41.84 
 
 
308 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  46.43 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.14 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  60.34 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  45.24 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  39.31 
 
 
283 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.78 
 
 
308 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
300 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  60.78 
 
 
296 aa  67.8  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 
297 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
289 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.29 
 
 
299 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.16 
 
 
303 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  41.61 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  38.51 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
288 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  34.53 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  39.47 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  37.86 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
381 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  38.24 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  43.97 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  36.11 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  38.57 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.64 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  37.09 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
298 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  37.59 
 
 
298 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
298 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
296 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  41.73 
 
 
343 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  39.46 
 
 
313 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.9 
 
 
297 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
296 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  39.04 
 
 
315 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.29 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>