54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0821 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 917 aa  1798    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  36.8 
 
 		 910 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  27.46 
 
 		 918 aa  271  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.1 
 
 		 880 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  28.09 
 
 		 878 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  26.69 
 
 		 875 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  25.16 
 
 		 875 aa  95.5  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  33.16 
 
 		 878 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  29.37 
 
 		 901 aa  76.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  25.9 
 
 		 892 aa  74.3  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  32.24 
 
 		 880 aa  74.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  26.6 
 
 		 880 aa  69.3  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  31.16 
 
 		 874 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  31.61 
 
 		 874 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  36.07 
 
 		 875 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  30.68 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1051 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  40.91 
 
 		 883 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  39.77 
 
 		 885 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  28.28 
 
 		 881 aa  62  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  41.24 
 
 		 874 aa  60.1  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  34.85 
 
 		 888 aa  59.3  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  34.59 
 
 		 875 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  28.36 
 
 		 877 aa  57  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  31.58 
 
 		 873 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  36.94 
 
 		 946 aa  55.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1047 aa  55.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  30.47 
 
 		 987 aa  55.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1351 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  29.94 
 
 		 1179 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1194 aa  52.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  34.09 
 
 		 870 aa  52.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.71 
 
 		 922 aa  52.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  42.47 
 
 		 883 aa  52  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.71 
 
 		 922 aa  51.6  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  29.69 
 
 		 987 aa  51.2  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  33.08 
 
 		 387 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1354 aa  51.2  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  23.31 
 
 		 787 aa  50.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1587  hypothetical protein  39.58 
 
 		 550 aa  50.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.820969  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0690  hypothetical protein  39.58 
 
 		 550 aa  50.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.372164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  34.41 
 
 		 1057 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1167 aa  50.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  39.71 
 
 		 532 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  35.48 
 
 		 812 aa  49.3  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  31.4 
 
 		 906 aa  48.5  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  29.1 
 
 		 993 aa  48.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 993 aa  47.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  34.58 
 
 		 1023 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1284 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 		 533 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  29.75 
 
 		 821 aa  45.4  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  33.78 
 
 		 384 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  30.16 
 
 		 814 aa  44.3  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>