More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0403 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0403  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 456 aa  939    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  27.24 
 
 		 830 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  23.47 
 
 		 578 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  22.43 
 
 		 578 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  26.03 
 
 		 570 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  22.06 
 
 		 575 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 604 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  23.72 
 
 		 596 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  23.13 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  25.52 
 
 		 590 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 		 1055 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  23.22 
 
 		 596 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.91 
 
 		 1165 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 589 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.9 
 
 		 862 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 584 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  23.26 
 
 		 598 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  23.11 
 
 		 597 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  23.43 
 
 		 599 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.07 
 
 		 1016 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  22.27 
 
 		 540 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 584 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  23.14 
 
 		 598 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.66 
 
 		 940 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  23.31 
 
 		 560 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  21.94 
 
 		 560 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.79 
 
 		 1047 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  24.21 
 
 		 608 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 609 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  25.5 
 
 		 610 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 626 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.5 
 
 		 1047 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  25.88 
 
 		 922 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.13 
 
 		 710 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 648 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.11 
 
 		 1089 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1410 aa  83.2  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 620 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  26.29 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.11 
 
 		 271 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.63 
 
 		 2654 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 780 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  19.81 
 
 		 1080 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.71 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  26.29 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  20.06 
 
 		 682 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  24.09 
 
 		 618 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 1255 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  23.95 
 
 		 1301 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  22.71 
 
 		 935 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  26.2 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  20.81 
 
 		 893 aa  78.2  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  22.03 
 
 		 2213 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  21 
 
 		 778 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 770 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  24.31 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.05 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  27.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.43 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  27.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  21.34 
 
 		 896 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.08 
 
 		 775 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  22.79 
 
 		 714 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  25.09 
 
 		 255 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  25.22 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  21.77 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  24.14 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  25.22 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.68 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 729 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  25.22 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  24.76 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  21.7 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0076  GGDEF domain-containing protein  24.43 
 
 		 941 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.71 
 
 		 1102 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.8 
 
 		 1109 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  24.59 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1459  cytidine deaminase  23.86 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.51 
 
 		 946 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>