159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4300 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3009  hypothetical protein  62.05 
 
 		 349 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3726  hypothetical protein  63.7 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.478649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  40 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  40.95 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  37.66 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  38.85 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  46.13 
 
 		 323 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  38.98 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  38.85 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0046  hypothetical protein  47.06 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2564  hypothetical protein  38.83 
 
 		 318 aa  219  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  38.54 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0852  hypothetical protein  38.54 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  38.54 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  38.22 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  38.22 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  38.22 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  38.79 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  38.1 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  39.81 
 
 		 320 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  38.05 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  39.48 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  39.48 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  39.48 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  39.48 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  40.54 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  36.17 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3618  hypothetical protein  42.59 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  36.56 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  36.56 
 
 		 317 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  36.59 
 
 		 326 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1659  hypothetical protein  42.66 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24810  hypothetical protein  39.67 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36700  hypothetical protein  38.85 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3152  hypothetical protein  37.69 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  26.69 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  27.61 
 
 		 850 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  27.61 
 
 		 850 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  27.95 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  27.95 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  26.67 
 
 		 584 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  26.94 
 
 		 850 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  26.1 
 
 		 850 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  24.53 
 
 		 881 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  28.36 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  28.36 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  26.1 
 
 		 850 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  25.64 
 
 		 850 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  29.19 
 
 		 692 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  25.27 
 
 		 850 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  30.63 
 
 		 739 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  31.92 
 
 		 896 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  25.82 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  26.73 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  25.18 
 
 		 517 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  27.69 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  26.79 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  28.24 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  26.71 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  29.79 
 
 		 844 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  25.91 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  25.93 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  29.25 
 
 		 864 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  25.93 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  23.63 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  25.68 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  28.62 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  25.69 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  34.93 
 
 		 864 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.8 
 
 		 872 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  26.03 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  34.32 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  24.59 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.35 
 
 		 844 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  24.15 
 
 		 313 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  28.06 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  30.8 
 
 		 850 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  29.39 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  28.57 
 
 		 877 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  28 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  26.73 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  27.08 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  34.45 
 
 		 864 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  33.97 
 
 		 864 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  25.95 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  30.29 
 
 		 850 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  34.45 
 
 		 889 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  34.45 
 
 		 889 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  31.94 
 
 		 864 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  30.21 
 
 		 854 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  29.26 
 
 		 866 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  26.1 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.67 
 
 		 863 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  34.45 
 
 		 889 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  29.67 
 
 		 863 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  23.55 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  24.74 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  29.3 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  27.18 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>