170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0842 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  99.37 
 
 
318 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  99.06 
 
 
318 aa  628  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0852  hypothetical protein  99.06 
 
 
318 aa  628  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  99.37 
 
 
318 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  98.43 
 
 
318 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  98.43 
 
 
318 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  98.43 
 
 
318 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2564  hypothetical protein  98.43 
 
 
318 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  88.36 
 
 
320 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  88.99 
 
 
320 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  88.99 
 
 
320 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  89.31 
 
 
320 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  88.99 
 
 
320 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  88.68 
 
 
320 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  51.6 
 
 
332 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  51.74 
 
 
332 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  47.78 
 
 
319 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  49.19 
 
 
317 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  45.43 
 
 
333 aa  291  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  49.37 
 
 
317 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  48.9 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  48.73 
 
 
317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  45.42 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24810  hypothetical protein  47.08 
 
 
316 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  43.87 
 
 
338 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0046  hypothetical protein  47.74 
 
 
332 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3152  hypothetical protein  48.22 
 
 
331 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36700  hypothetical protein  47.9 
 
 
331 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  41.48 
 
 
321 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  44.44 
 
 
323 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1659  hypothetical protein  42.51 
 
 
337 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4300  hypothetical protein  39.03 
 
 
386 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3618  hypothetical protein  45.03 
 
 
333 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3726  hypothetical protein  40.93 
 
 
355 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.478649  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3009  hypothetical protein  40.93 
 
 
349 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  33.71 
 
 
311 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  29.25 
 
 
850 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  28.75 
 
 
850 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  28.75 
 
 
850 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  28.94 
 
 
850 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  26.69 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  28.42 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  29.97 
 
 
850 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  31.72 
 
 
317 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  31.72 
 
 
317 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  28.12 
 
 
584 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.34 
 
 
813 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  31.25 
 
 
881 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  28.81 
 
 
850 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  29.14 
 
 
850 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  30.74 
 
 
517 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  32.2 
 
 
872 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  32.51 
 
 
896 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  29.22 
 
 
317 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  28.39 
 
 
351 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  29.1 
 
 
320 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  29.1 
 
 
320 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  30.53 
 
 
516 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  34.48 
 
 
739 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  28.79 
 
 
343 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  27.05 
 
 
313 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  28.79 
 
 
343 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  28.93 
 
 
864 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  30.9 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  29.34 
 
 
844 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  29.25 
 
 
692 aa  99  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  28.81 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  29.06 
 
 
313 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  30.69 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  27.65 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.93 
 
 
844 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  32.37 
 
 
850 aa  93.2  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  31.23 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  28.4 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  30.18 
 
 
875 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  28.09 
 
 
323 aa  89.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  28.09 
 
 
323 aa  89  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  27.48 
 
 
869 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  28.05 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  26.97 
 
 
870 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  29.67 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  29.57 
 
 
362 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  30.08 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  31.28 
 
 
866 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  27.3 
 
 
877 aa  86.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  29.17 
 
 
855 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  26.25 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  29.46 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  27.78 
 
 
393 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  29.92 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  29.46 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  28.01 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  27.12 
 
 
871 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  29.3 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  27.12 
 
 
871 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  29.24 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  28.32 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  28.1 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  28.18 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>