165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3276 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  94.32 
 
 		 332 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  59.34 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  60 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  59.34 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  58.36 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  55.12 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  56.01 
 
 		 326 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  52.68 
 
 		 318 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2564  hypothetical protein  52.37 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0852  hypothetical protein  52.37 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  52.05 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  52.05 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  51.74 
 
 		 318 aa  305  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  52.05 
 
 		 318 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  52.05 
 
 		 318 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  51.74 
 
 		 318 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  49.22 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  48.05 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36700  hypothetical protein  58.71 
 
 		 331 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  50.64 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  50.64 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  50.64 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  50.64 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  50.32 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3152  hypothetical protein  57.47 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  46.79 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24810  hypothetical protein  52.46 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0046  hypothetical protein  47.85 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3618  hypothetical protein  48.38 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  45.51 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  38.41 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1659  hypothetical protein  43.68 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4300  hypothetical protein  37.03 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3009  hypothetical protein  40.47 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3726  hypothetical protein  40.08 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.478649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  31.06 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  32.01 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  30.71 
 
 		 314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  30.54 
 
 		 584 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  32.32 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  32.32 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  28.2 
 
 		 850 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  28.2 
 
 		 850 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  30.71 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  28.43 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  27.87 
 
 		 850 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  29.83 
 
 		 872 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  26.58 
 
 		 881 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  32.39 
 
 		 869 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  27.57 
 
 		 850 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  30.61 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  30.61 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.82 
 
 		 813 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  27.88 
 
 		 368 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  27.55 
 
 		 850 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  27.55 
 
 		 850 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  31.53 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  28.04 
 
 		 870 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  35.34 
 
 		 896 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  27.12 
 
 		 850 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  25.67 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  30.48 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  31.5 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  31.76 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  29.06 
 
 		 516 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  28.91 
 
 		 867 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  29.15 
 
 		 867 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  30.52 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  26.79 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  30.52 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  25.46 
 
 		 351 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  25.23 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  29.62 
 
 		 739 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  28.17 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  27.36 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  31.56 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 393 aa  92.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  26.62 
 
 		 875 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  29.35 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  32.75 
 
 		 850 aa  89.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  27.99 
 
 		 863 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  26.54 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  27.99 
 
 		 863 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  26.91 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  26.71 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  25.31 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  26.25 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  26.58 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  25.83 
 
 		 353 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  30.67 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  26.6 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  27.67 
 
 		 864 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  27.04 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  27.67 
 
 		 844 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  28.15 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  25.17 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>