158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4608 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  40.31 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  38.98 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  41.48 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  43.45 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  43.45 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  43.2 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  41.8 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2564  hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0852  hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  42.76 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  39.33 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  38.38 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  41.94 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  41.61 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  41.61 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  41.61 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  41.61 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  42.86 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  42.52 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24810  hypothetical protein  42.9 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  42.52 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0046  hypothetical protein  42.09 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  40.67 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  40.6 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4300  hypothetical protein  40.54 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3618  hypothetical protein  41.18 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1659  hypothetical protein  41.52 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3152  hypothetical protein  39.93 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36700  hypothetical protein  38.98 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3726  hypothetical protein  38.91 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.478649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3009  hypothetical protein  38.91 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  28.72 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  28.87 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  27.15 
 
 		 850 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  28.12 
 
 		 517 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  25.43 
 
 		 850 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  25.77 
 
 		 850 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  27.45 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  27.8 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  28.87 
 
 		 739 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  31.34 
 
 		 864 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  30.99 
 
 		 844 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  28.41 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  29.17 
 
 		 863 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.17 
 
 		 863 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  27.84 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  29.32 
 
 		 896 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  27.21 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  26.79 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  30.63 
 
 		 844 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  27.39 
 
 		 692 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  26.76 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  27.76 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  25.87 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  27.43 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  28.57 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  25.66 
 
 		 875 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  25.72 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  25.82 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  25.82 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  27.85 
 
 		 870 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  26.45 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  29.02 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  26.62 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  25.99 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  28.37 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  27.24 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  25.7 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  28.87 
 
 		 867 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  32.26 
 
 		 855 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  24.41 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  27.27 
 
 		 871 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  26.64 
 
 		 881 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  27.27 
 
 		 871 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  27.18 
 
 		 867 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  28.23 
 
 		 864 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  24.25 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  25.5 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  26.55 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  28.52 
 
 		 864 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  26.55 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  24.22 
 
 		 850 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  28.42 
 
 		 850 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  23.53 
 
 		 850 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  23.99 
 
 		 850 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  28.33 
 
 		 869 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  25.75 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  24.22 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  24.62 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  24.45 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  27.15 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  31.58 
 
 		 872 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  25.24 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  27.09 
 
 		 864 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  29.81 
 
 		 850 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>