170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00772 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0852  hypothetical protein  99.37 
 
 		 318 aa  627  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  99.06 
 
 		 318 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  98.74 
 
 		 318 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  98.11 
 
 		 318 aa  624  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  99.06 
 
 		 318 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2564  hypothetical protein  98.74 
 
 		 318 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  98.43 
 
 		 318 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  89.31 
 
 		 320 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  88.36 
 
 		 320 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  88.68 
 
 		 320 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  88.99 
 
 		 320 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  88.99 
 
 		 320 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  88.99 
 
 		 320 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  51.92 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  52.05 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  47.78 
 
 		 319 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  45.74 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  48.53 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  48.9 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  48.73 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  48.1 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  45.1 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24810  hypothetical protein  47.08 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  43.55 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0046  hypothetical protein  47.42 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3152  hypothetical protein  48.22 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36700  hypothetical protein  47.9 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  41.8 
 
 		 321 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  44.12 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1659  hypothetical protein  42.51 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4300  hypothetical protein  38.39 
 
 		 386 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3618  hypothetical protein  44.37 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3726  hypothetical protein  40.93 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.478649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3009  hypothetical protein  40.93 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  29.25 
 
 		 850 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  28.75 
 
 		 850 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  28.75 
 
 		 850 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  28.35 
 
 		 584 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  26.69 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  28.78 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  28.94 
 
 		 850 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.7 
 
 		 813 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  32.09 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  32.09 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  29.47 
 
 		 850 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  31.25 
 
 		 881 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  32.64 
 
 		 896 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  31.07 
 
 		 517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  29.14 
 
 		 850 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  28.81 
 
 		 850 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  32.2 
 
 		 872 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  29.22 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  30.53 
 
 		 516 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  28.71 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  34.87 
 
 		 739 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  28.67 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  28.67 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  27.05 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  30.56 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  28.93 
 
 		 864 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  29.86 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  29.34 
 
 		 844 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  29.25 
 
 		 692 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  33.2 
 
 		 850 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  30.19 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  28.03 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.93 
 
 		 844 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  29.72 
 
 		 875 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  29.59 
 
 		 869 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  27.3 
 
 		 870 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  28.05 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  28.02 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  30.56 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  30.08 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 393 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  28.46 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  29.67 
 
 		 350 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  28.46 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  28.34 
 
 		 353 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  29.57 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  27.56 
 
 		 877 aa  85.9  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  31.28 
 
 		 866 aa  85.9  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  29.46 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  29.46 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  26.25 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  27.12 
 
 		 871 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  27.12 
 
 		 871 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  29.92 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  28.24 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  27.59 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  28.32 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  29.24 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  28.47 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  27.87 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>