169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0874 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  99.69 
 
 
320 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  100 
 
 
320 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  100 
 
 
320 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  99.69 
 
 
320 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  89.94 
 
 
318 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  89.62 
 
 
318 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  89.31 
 
 
318 aa  560  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  89.62 
 
 
318 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  88.99 
 
 
318 aa  557  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0852  hypothetical protein  89.31 
 
 
318 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  88.99 
 
 
318 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2564  hypothetical protein  88.68 
 
 
318 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  88.99 
 
 
318 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  86.88 
 
 
320 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  50 
 
 
332 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  47.48 
 
 
319 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  45.31 
 
 
333 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  48.69 
 
 
317 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  50.64 
 
 
332 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  49.68 
 
 
326 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  48.89 
 
 
317 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  48.25 
 
 
317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  47.39 
 
 
340 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24810  hypothetical protein  48.05 
 
 
316 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  45.48 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0046  hypothetical protein  48.39 
 
 
332 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3152  hypothetical protein  48.22 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36700  hypothetical protein  48.22 
 
 
331 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  41.48 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  45.75 
 
 
323 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1659  hypothetical protein  44.06 
 
 
337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3618  hypothetical protein  46.36 
 
 
333 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4300  hypothetical protein  39.48 
 
 
386 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3726  hypothetical protein  40.54 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.478649  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3009  hypothetical protein  40.54 
 
 
349 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  34.09 
 
 
311 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  29.57 
 
 
850 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  29.57 
 
 
850 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  29.24 
 
 
850 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  29.37 
 
 
312 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  26.33 
 
 
314 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  29.14 
 
 
584 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  31.95 
 
 
881 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  30.1 
 
 
517 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  33.33 
 
 
872 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  30.63 
 
 
317 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  32.69 
 
 
516 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  31.46 
 
 
317 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  32.23 
 
 
896 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  26.62 
 
 
813 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  29.32 
 
 
317 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  30.28 
 
 
320 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  27.51 
 
 
850 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  30.28 
 
 
320 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  28.9 
 
 
320 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  29.25 
 
 
343 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  29.25 
 
 
343 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  27.05 
 
 
313 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  29.7 
 
 
317 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  33.46 
 
 
739 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  28.35 
 
 
351 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  29.63 
 
 
864 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  27.48 
 
 
850 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  29.81 
 
 
356 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  26.73 
 
 
850 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  27.15 
 
 
850 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  29.63 
 
 
844 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  29.87 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  28.37 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  29.97 
 
 
368 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  29.82 
 
 
875 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  28.79 
 
 
315 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  29.11 
 
 
871 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  29.28 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  29.11 
 
 
871 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  28.43 
 
 
870 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  30.72 
 
 
866 aa  90.5  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  29.22 
 
 
844 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  27.01 
 
 
323 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  27.01 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  31.95 
 
 
850 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  30.55 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  27.9 
 
 
692 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  26.3 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  25.31 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  27.15 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  26.56 
 
 
353 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  28.62 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  26.82 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  27.53 
 
 
869 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  30.65 
 
 
877 aa  82.8  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  26.64 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  27.17 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  29.37 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  29.92 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  28.63 
 
 
855 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  27.02 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  29.67 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.58 
 
 
863 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>