More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3778 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
462 aa  895    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  35.97 
 
 
448 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
459 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
490 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  34.41 
 
 
458 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  27.55 
 
 
444 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  30.07 
 
 
462 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
465 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
439 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
472 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
465 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  34.69 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
471 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
464 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  42.24 
 
 
317 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  32.69 
 
 
471 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
460 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
481 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  32.45 
 
 
471 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
458 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  27.96 
 
 
449 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  37.44 
 
 
448 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  38.19 
 
 
448 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  33.04 
 
 
456 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
465 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
459 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
441 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  27.59 
 
 
473 aa  151  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  32.87 
 
 
445 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  33.33 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  29.44 
 
 
467 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
478 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  31.06 
 
 
436 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
484 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  29.22 
 
 
442 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  28.6 
 
 
441 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
442 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
467 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  30.16 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  29.71 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  30.18 
 
 
436 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  35.88 
 
 
452 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
467 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
450 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  30.09 
 
 
432 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  33.87 
 
 
464 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
446 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
446 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  34.75 
 
 
471 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
460 aa  136  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  29.55 
 
 
471 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
444 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  33.77 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
445 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
442 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  31.9 
 
 
482 aa  126  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
454 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
458 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
439 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  30.37 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  30.85 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  31.23 
 
 
482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
441 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  28.08 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  31.82 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
441 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
474 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
442 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  34.68 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  33.33 
 
 
451 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
482 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
466 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
459 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.819337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>