More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0153 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  100 
 
 
516 aa  1053    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  59.5 
 
 
520 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  59.88 
 
 
535 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  58.22 
 
 
520 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  51.36 
 
 
516 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  51.45 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  49.52 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  49.22 
 
 
543 aa  498  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  48.83 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  48.8 
 
 
504 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  37.29 
 
 
562 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  38.55 
 
 
551 aa  348  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  36.8 
 
 
568 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  36.91 
 
 
565 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  41.46 
 
 
570 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  43.54 
 
 
566 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  41.96 
 
 
570 aa  302  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  41.15 
 
 
604 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  33.62 
 
 
494 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  33.48 
 
 
503 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  35.62 
 
 
531 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  35.05 
 
 
503 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  34.84 
 
 
496 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  33.4 
 
 
537 aa  274  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  32.3 
 
 
543 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  34.41 
 
 
496 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  34.16 
 
 
515 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  33.07 
 
 
512 aa  270  4e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  33.33 
 
 
525 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  34.18 
 
 
564 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  32.82 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  32.26 
 
 
487 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  35.14 
 
 
919 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  35.88 
 
 
497 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  34.99 
 
 
903 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  35.23 
 
 
517 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  35.41 
 
 
500 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  35.14 
 
 
741 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  31.43 
 
 
495 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  32.03 
 
 
562 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  33.71 
 
 
792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  33.96 
 
 
866 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  30.95 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  31.13 
 
 
559 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  32.78 
 
 
571 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  36.01 
 
 
942 aa  253  6e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  32.8 
 
 
808 aa  253  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  31.26 
 
 
489 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  31.18 
 
 
496 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  31.18 
 
 
496 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  33.33 
 
 
1141 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  32.23 
 
 
530 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  33.18 
 
 
806 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  33.97 
 
 
507 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  31.48 
 
 
489 aa  250  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  34.08 
 
 
491 aa  249  8e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  33.87 
 
 
411 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  36.17 
 
 
764 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  34.63 
 
 
926 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  33.49 
 
 
489 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  32.26 
 
 
636 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  30.79 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  33.17 
 
 
489 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  31.83 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  31.4 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  30.99 
 
 
496 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  31.4 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  29.98 
 
 
483 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0656  ribonuclease E  33.69 
 
 
998 aa  244  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  30.56 
 
 
489 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  30.75 
 
 
489 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  31.18 
 
 
489 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  30.32 
 
 
489 aa  244  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  31.18 
 
 
489 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  33.33 
 
 
503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  34.1 
 
 
1015 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  30.35 
 
 
483 aa  243  6e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  31.42 
 
 
497 aa  243  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  30.34 
 
 
492 aa  243  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  30.34 
 
 
489 aa  243  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  31.59 
 
 
1111 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  32.3 
 
 
486 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  32.48 
 
 
1068 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1173  ribonuclease E  33.26 
 
 
1040 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  32.94 
 
 
491 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1874  ribonuclease, Rne/Rng family  33.96 
 
 
782 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000717737  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  32.04 
 
 
490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2220  ribonuclease, Rne/Rng family  33.96 
 
 
782 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  30.95 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  34.64 
 
 
688 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  30.32 
 
 
489 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  30.32 
 
 
489 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  30.32 
 
 
489 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0965713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>