More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3325 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3325  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  583  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3130  LysR family transcriptional regulator  96.15 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.171352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0952  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3551  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3426  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3354  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 299 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06019  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1650  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0991  transcriptional regulator, LysR family  40.33 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0931  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0988  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  30.27 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  36.73 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0873  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  36.17 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 297 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.23 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 298 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  31.88 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2722  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1129  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 304 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  32.63 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  37.42 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.62 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2413  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.99 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4494  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.07 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3744  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4821  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  29.93 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  30.43 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2202  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4317  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135379  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  35.17 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>