More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0244 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  51.01 
 
 		 169 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  52.67 
 
 		 226 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 225 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 225 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 225 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 225 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 225 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  59.05 
 
 		 226 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  53.08 
 
 		 225 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  60 
 
 		 225 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  52.31 
 
 		 225 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  52.31 
 
 		 225 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1619  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 		 227 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  50.77 
 
 		 227 aa  130  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  53.97 
 
 		 236 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  47.37 
 
 		 227 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  43.33 
 
 		 231 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  48.51 
 
 		 229 aa  125  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  41.45 
 
 		 233 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  46.92 
 
 		 229 aa  124  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  48.46 
 
 		 235 aa  123  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  45.89 
 
 		 227 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  49.19 
 
 		 227 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  47.92 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  42.48 
 
 		 206 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  53.33 
 
 		 233 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  48.39 
 
 		 227 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  51.89 
 
 		 229 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  48.7 
 
 		 230 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  53 
 
 		 231 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 168 aa  116  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  45.31 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  52 
 
 		 231 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  45.32 
 
 		 225 aa  114  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  47.66 
 
 		 225 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  39.31 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 245 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 220 aa  110  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  41.29 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  48.04 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  49.53 
 
 		 223 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  43.61 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  49.02 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  46.9 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  49.02 
 
 		 230 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  48.6 
 
 		 222 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  38.03 
 
 		 222 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  44.9 
 
 		 232 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  48.04 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  34.67 
 
 		 228 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  48.04 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  44.66 
 
 		 222 aa  103  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  46.08 
 
 		 228 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  44.66 
 
 		 215 aa  103  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  47.06 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  44.62 
 
 		 233 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 228 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 222 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  38.73 
 
 		 228 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  45.63 
 
 		 225 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  43.93 
 
 		 223 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  42.02 
 
 		 241 aa  100  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  39.84 
 
 		 225 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  41.6 
 
 		 225 aa  100  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 229 aa  100  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  39.6 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  36.6 
 
 		 223 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 227 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 222 aa  99.4  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 222 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3561  DNA repair protein RadC  41.6 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  41.35 
 
 		 224 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1216  DNA repair protein  40.82 
 
 		 206 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  44.66 
 
 		 223 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  40.57 
 
 		 232 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  43.08 
 
 		 233 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  43.27 
 
 		 224 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  39.33 
 
 		 225 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  32.89 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1867  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 168 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  32.24 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  42.31 
 
 		 224 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3005  DNA repair protein RadC  33.56 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 225 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  41.18 
 
 		 224 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  39.22 
 
 		 234 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  35.48 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  41.75 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  41.46 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>