More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3561 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3561  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 147 aa  303  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  45.22 
 
 		 167 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  37.32 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  37.32 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  44.04 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  44.63 
 
 		 234 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  38.73 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  44.92 
 
 		 233 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  41.22 
 
 		 227 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  44.07 
 
 		 236 aa  103  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 229 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  36.17 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  44.07 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  39.04 
 
 		 241 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  39.69 
 
 		 227 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  34.51 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  41.53 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  40.65 
 
 		 227 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  41.23 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 233 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  37.88 
 
 		 231 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  40.16 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  41.6 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  37.76 
 
 		 227 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  43.33 
 
 		 232 aa  98.6  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  32.12 
 
 		 166 aa  97.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  33.8 
 
 		 169 aa  97.1  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  46.73 
 
 		 229 aa  97.1  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  39.83 
 
 		 226 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  41.53 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  46.6 
 
 		 275 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 233 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 225 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  40.5 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  37.82 
 
 		 225 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  36.11 
 
 		 228 aa  94.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  36.3 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  37.82 
 
 		 225 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  37.01 
 
 		 229 aa  94  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  45.63 
 
 		 275 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 225 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 249 aa  93.2  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  37.82 
 
 		 225 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  37.82 
 
 		 225 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  37.82 
 
 		 225 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 246 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 221 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 221 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  37.82 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  43.52 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 221 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  37.82 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  40.17 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  40.34 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 221 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  34.75 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 221 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  37.3 
 
 		 221 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  44.66 
 
 		 278 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  44.66 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  41.03 
 
 		 224 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  42.72 
 
 		 249 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  39.02 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  39.02 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  40.87 
 
 		 230 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  39.83 
 
 		 229 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  40.17 
 
 		 224 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  35.83 
 
 		 225 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 228 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  35.54 
 
 		 221 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  42.48 
 
 		 229 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  34.78 
 
 		 222 aa  87  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  46.91 
 
 		 232 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  33.59 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 229 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 224 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  33.88 
 
 		 222 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 222 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 222 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  36.23 
 
 		 222 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  40.78 
 
 		 257 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  33.88 
 
 		 222 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  39.5 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  32.85 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1619  DNA repair protein RadC  37.3 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  41.75 
 
 		 263 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 222 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  35.83 
 
 		 228 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  40.74 
 
 		 224 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  35.34 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  32.23 
 
 		 228 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 258 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  39.81 
 
 		 265 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  33.88 
 
 		 222 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  33.88 
 
 		 214 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  35.2 
 
 		 225 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1216  DNA repair protein  31.39 
 
 		 206 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  33.88 
 
 		 221 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>