More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1304 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  58.66 
 
 
555 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  59.01 
 
 
555 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  59.39 
 
 
558 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  59.67 
 
 
553 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  60.22 
 
 
553 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  58.2 
 
 
545 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  59.39 
 
 
555 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  60.22 
 
 
553 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 
535 aa  1099    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  71.62 
 
 
545 aa  798    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  58.48 
 
 
550 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  59.66 
 
 
558 aa  630  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  60.15 
 
 
559 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  60.15 
 
 
559 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  55.22 
 
 
570 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  56.12 
 
 
579 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  59.39 
 
 
553 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  59.39 
 
 
553 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  55.14 
 
 
569 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  58.27 
 
 
584 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  59.51 
 
 
553 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  59.32 
 
 
553 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  59.32 
 
 
553 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  59.32 
 
 
553 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  54.61 
 
 
569 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  59.32 
 
 
553 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  58.14 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  58.88 
 
 
563 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  57.06 
 
 
563 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  53.58 
 
 
541 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  55.47 
 
 
540 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  56.11 
 
 
535 aa  581  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  56.73 
 
 
578 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  55.25 
 
 
554 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  55.56 
 
 
540 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  54.82 
 
 
535 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  52.62 
 
 
541 aa  535  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  53.52 
 
 
535 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  53.03 
 
 
544 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  53.54 
 
 
546 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  52.85 
 
 
524 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  39.21 
 
 
564 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  37.48 
 
 
570 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  37.79 
 
 
581 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  38.55 
 
 
577 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.63 
 
 
550 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
551 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  39.27 
 
 
550 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
583 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
588 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  38.58 
 
 
561 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  38.45 
 
 
585 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  38.01 
 
 
578 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  37.52 
 
 
572 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  39.33 
 
 
586 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.36 
 
 
554 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  38.14 
 
 
547 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  35.03 
 
 
557 aa  294  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  37.15 
 
 
594 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  37.6 
 
 
484 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 
525 aa  240  5e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  31.92 
 
 
504 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 
548 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.48 
 
 
546 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  29.19 
 
 
548 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  29.19 
 
 
548 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.57 
 
 
546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 
550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.87 
 
 
550 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.73 
 
 
537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 
574 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  27.64 
 
 
574 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 
549 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  29.96 
 
 
548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
548 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.99 
 
 
511 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
548 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
533 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  30.02 
 
 
611 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  29.77 
 
 
414 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  32.94 
 
 
509 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.13 
 
 
505 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.6 
 
 
605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.19 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.19 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  28.54 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  28.38 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  32.47 
 
 
506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.24 
 
 
501 aa  147  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  27.15 
 
 
544 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  30.62 
 
 
479 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  31.62 
 
 
494 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  30.43 
 
 
388 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.28 
 
 
489 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  29.87 
 
 
538 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
486 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.87 
 
 
538 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  31.17 
 
 
497 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  29.88 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>