More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0235 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 291 aa  574  1.0000000000000001e-163  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0095  preprotein translocase subunit SecF  49.82 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0058  preprotein translocase subunit SecF  51.25 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  39.24 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  37.29 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  38.14 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  38.01 
 
 		 367 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  37.67 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  38.01 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  36.61 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  35.14 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  37.67 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.52 
 
 		 839 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.21 
 
 		 845 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.49 
 
 		 853 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.86 
 
 		 844 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  38.31 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  35.14 
 
 		 357 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  34.59 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.68 
 
 		 846 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.92 
 
 		 785 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.55 
 
 		 844 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.92 
 
 		 785 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.39 
 
 		 856 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.15 
 
 		 849 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 323 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.93 
 
 		 759 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  36.17 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  37.46 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.41 
 
 		 856 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  36.18 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.8 
 
 		 848 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  35.25 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  32.53 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  37.28 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.28 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  32.53 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  32.53 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  34.53 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.54 
 
 		 834 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.48 
 
 		 844 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1454  protein translocase subunit secF  36.52 
 
 		 321 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  35.14 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  32.21 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0980  preprotein translocase subunit SecF  31.9 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00161117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  33.45 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.23 
 
 		 846 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  33.92 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2498  protein-export membrane protein SecF  35.56 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  33.94 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  31.9 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  31.33 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2492  protein-export membrane protein SecF  32.87 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27994  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34.17 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2189  protein-export membrane protein SecF  32.76 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  34.21 
 
 		 322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  30.31 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  35.59 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  34.7 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  35.23 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  29.79 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3399  protein-export membrane protein SecF  33.58 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  decreased coverage  0.000027343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  32.61 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  34.93 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  32.98 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000523  protein-export membrane protein SecF  34.46 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  34.35 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  30.91 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  35.18 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  35.11 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  30.39 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  32.04 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  32.62 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  33.81 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  31.32 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3249  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>