More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0796 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  88.46 
 
 		 254 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 233 aa  295  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.72 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.43 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  52.56 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.65 
 
 		 240 aa  235  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  47.23 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50.21 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  48.71 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.07 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  48.93 
 
 		 237 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 233 aa  234  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  49.14 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  49.36 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50.85 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.5 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  49.14 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  49.14 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.15 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  47.41 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  47.01 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  47.01 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  46.58 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.09 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  51.27 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  46.81 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  228  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  50.21 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  49.14 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  47.44 
 
 		 265 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  50.42 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  50.9 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  48.28 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.15 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  47.01 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  48.5 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  48.28 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  48.07 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  48.5 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  48.94 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  50.42 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  47.84 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  50.86 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  48.5 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.29 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  50.84 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  48.5 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  53.85 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>