More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2851 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  74.48 
 
 		 494 aa  741    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 		 493 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1018    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  74.8 
 
 		 490 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 		 490 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  74.8 
 
 		 490 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  73.57 
 
 		 495 aa  721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  73.35 
 
 		 491 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  74.85 
 
 		 490 aa  728    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 509 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 492 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  65.22 
 
 		 501 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 		 504 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  64.67 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 501 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  64.21 
 
 		 503 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  63.79 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 532 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  58.2 
 
 		 517 aa  580  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 		 506 aa  578  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 491 aa  581  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 494 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 484 aa  339  7e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 487 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 473 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 496 aa  336  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 469 aa  333  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 500 aa  329  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 482 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 478 aa  326  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 488 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 492 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 504 aa  320  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.23 
 
 		 495 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 507 aa  316  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 490 aa  314  2.9999999999999996e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 468 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 501 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 455 aa  312  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 467 aa  310  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 467 aa  309  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 491 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 463 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 470 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 490 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 506 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 479 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 466 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 462 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>