More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0070 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
338 aa  686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.11 
 
 
342 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  70.5 
 
 
347 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.02 
 
 
340 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.65 
 
 
349 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.96 
 
 
350 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.37 
 
 
349 aa  356  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.66 
 
 
346 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 
346 aa  355  5.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
336 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  49.12 
 
 
353 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  49.39 
 
 
342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.75 
 
 
342 aa  309  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 
342 aa  305  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.46 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 
353 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.2 
 
 
351 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  47.2 
 
 
351 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.21 
 
 
342 aa  291  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.37 
 
 
352 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  47.76 
 
 
326 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.61 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 
348 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.81 
 
 
368 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.86 
 
 
356 aa  205  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.2 
 
 
724 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
501 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
510 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 
459 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  40.48 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  36.42 
 
 
346 aa  186  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.42 
 
 
344 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.06 
 
 
312 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.51 
 
 
315 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  35.42 
 
 
352 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
312 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.76 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.63 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 
330 aa  162  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 
328 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
325 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
315 aa  143  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  28.84 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  29.22 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
310 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
310 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
310 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
312 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
325 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
319 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
333 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
321 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  27.51 
 
 
319 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  32.84 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  30.51 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  33.21 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  31.85 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.76 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 
327 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.03 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  29.38 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.02 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.15 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.88 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  31.15 
 
 
329 aa  90.1  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.95 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
315 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.39 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  31.59 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  29.39 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  29.38 
 
 
313 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.13 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.88 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  30.97 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.36 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  31.02 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  29.39 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>