More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0643 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  78.88 
 
 		 235 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  77.39 
 
 		 233 aa  370  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  76.52 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  63.88 
 
 		 231 aa  301  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  62.95 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  62.11 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  63.72 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  60 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  61.74 
 
 		 232 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  58.56 
 
 		 230 aa  275  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 236 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 241 aa  268  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.14 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 232 aa  264  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 231 aa  264  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 242 aa  264  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 235 aa  263  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  53.95 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  54.89 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  54.98 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 234 aa  261  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 235 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  54.98 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  57.02 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  53.25 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  59.45 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 229 aa  258  7e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 233 aa  257  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 233 aa  256  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  54.46 
 
 		 230 aa  255  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 231 aa  254  9e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  53.48 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  53.91 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 231 aa  252  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  57.4 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  57.4 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  52.81 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  52.81 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 232 aa  251  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  52.16 
 
 		 282 aa  250  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  53.45 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 239 aa  248  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  52.5 
 
 		 259 aa  247  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>