More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2983 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 1144 aa  2243    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 1158 aa  432  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  33.37 
 
 		 1111 aa  413  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  32.96 
 
 		 1127 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  32.22 
 
 		 1120 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  32.53 
 
 		 1102 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  32.22 
 
 		 1120 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  32.22 
 
 		 1120 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  33.1 
 
 		 1102 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  32.68 
 
 		 1134 aa  366  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  32.28 
 
 		 1102 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 861 aa  362  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  32.49 
 
 		 1102 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  33.88 
 
 		 1115 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  32.02 
 
 		 1134 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  30.6 
 
 		 1117 aa  355  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  32 
 
 		 1128 aa  351  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  30.5 
 
 		 1120 aa  348  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 1120 aa  348  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  30.5 
 
 		 1120 aa  348  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  30.5 
 
 		 1120 aa  348  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1120 aa  348  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  30.5 
 
 		 1120 aa  347  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  30.54 
 
 		 1120 aa  347  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  30.54 
 
 		 1118 aa  346  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  30.99 
 
 		 1118 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1120 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  30.76 
 
 		 1130 aa  344  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  33.41 
 
 		 1110 aa  344  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  31.31 
 
 		 1118 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  31.33 
 
 		 1117 aa  343  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  31.45 
 
 		 1133 aa  342  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  32.9 
 
 		 1120 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  32.9 
 
 		 1118 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  32.9 
 
 		 1118 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  32.9 
 
 		 1118 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  32.9 
 
 		 1120 aa  338  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  31.93 
 
 		 1098 aa  336  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  33.53 
 
 		 1110 aa  334  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 1235 aa  332  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1103 aa  332  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1108 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1108 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1108 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1108 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1108 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1115 aa  330  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 1105 aa  326  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1107 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1107 aa  322  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1107 aa  321  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  28.39 
 
 		 1107 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 1107 aa  320  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1107 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1107 aa  320  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1107 aa  320  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1107 aa  320  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 1078 aa  320  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1107 aa  319  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1107 aa  318  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  26.95 
 
 		 1080 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1107 aa  313  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1104 aa  310  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  41.6 
 
 		 1166 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 1067 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 1067 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  29.09 
 
 		 1067 aa  303  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 1067 aa  301  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 1060 aa  300  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 1072 aa  299  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 1070 aa  298  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 1072 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.55 
 
 		 1067 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 1072 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 		 1068 aa  292  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 1066 aa  289  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 1062 aa  282  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1113 aa  280  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1113 aa  280  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1113 aa  279  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  38.77 
 
 		 806 aa  204  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  42.73 
 
 		 864 aa  191  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  43.03 
 
 		 299 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 		 874 aa  187  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  38.87 
 
 		 291 aa  184  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 298 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  31.69 
 
 		 825 aa  179  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 877 aa  177  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.1 
 
 		 840 aa  177  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  45.03 
 
 		 636 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  45.03 
 
 		 636 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  41.74 
 
 		 860 aa  176  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 		 843 aa  175  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  39.34 
 
 		 843 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  39.11 
 
 		 981 aa  172  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  39.92 
 
 		 844 aa  172  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 849 aa  172  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 796 aa  171  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  38.07 
 
 		 816 aa  171  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  37.6 
 
 		 322 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>