More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1527 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  63.44 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  59.79 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  62.89 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  62.64 
 
 		 257 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 163 aa  111  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 167 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  56.38 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  54.81 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 127 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  47.93 
 
 		 153 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  55.06 
 
 		 181 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 137 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  63.29 
 
 		 124 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  48.42 
 
 		 137 aa  92.4  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 137 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  54.76 
 
 		 150 aa  91.7  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 137 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 371 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  57.95 
 
 		 142 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 127 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 137 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 119 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 134 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 170 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 127 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  61.97 
 
 		 124 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 360 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 360 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  50 
 
 		 171 aa  89  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 360 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  49.07 
 
 		 115 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  49.07 
 
 		 115 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 131 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  54.12 
 
 		 115 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  47.22 
 
 		 120 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 131 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  49.43 
 
 		 144 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  58.02 
 
 		 116 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.15 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  49.48 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 147 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 120 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  46.08 
 
 		 339 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  35.14 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 163 aa  85.9  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  45.19 
 
 		 314 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 408 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  50 
 
 		 133 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 362 aa  85.1  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0694  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 377 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3012  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000245758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  46.6 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 121 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 121 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  46.94 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.88 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  55.95 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  59.46 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  48.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  55.95 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  40 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  43.3 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  48.81 
 
 		 118 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  43.3 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  44.33 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  43.3 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  48.81 
 
 		 118 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  50 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 122 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  55.95 
 
 		 124 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  47.13 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>