More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1239 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  100 
 
 
449 aa  921    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  66.23 
 
 
513 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  67.64 
 
 
448 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  70.85 
 
 
453 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  71.52 
 
 
453 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  66.22 
 
 
450 aa  630  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  54.41 
 
 
457 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  53.1 
 
 
454 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  50.67 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  50.67 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  49.23 
 
 
458 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  39.96 
 
 
472 aa  315  8e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  40.17 
 
 
472 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  39.96 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  39.96 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  39.96 
 
 
472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  38.46 
 
 
463 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  40.1 
 
 
470 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  35.17 
 
 
477 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  42.45 
 
 
295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1173  hypothetical protein  41.21 
 
 
189 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00228603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  26.85 
 
 
452 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.89 
 
 
1102 aa  94.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
918 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
1082 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.57 
 
 
918 aa  93.2  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  24.79 
 
 
1064 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 
918 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.57 
 
 
918 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  24.79 
 
 
1064 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  24.79 
 
 
1064 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  24.79 
 
 
1064 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  24.79 
 
 
1064 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  24.36 
 
 
918 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.36 
 
 
918 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  23.92 
 
 
918 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.36 
 
 
918 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  24.36 
 
 
918 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  23.24 
 
 
918 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  24.95 
 
 
674 aa  90.9  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  24.57 
 
 
1064 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  24.15 
 
 
918 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  24.26 
 
 
1064 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  23.94 
 
 
1066 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
1068 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  25.29 
 
 
1086 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.66 
 
 
907 aa  87.4  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  25.21 
 
 
1084 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  25.16 
 
 
1084 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  23.71 
 
 
1032 aa  87  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  24.16 
 
 
1064 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.37 
 
 
1082 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  24.27 
 
 
809 aa  84.7  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  24.63 
 
 
1134 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  24.22 
 
 
1064 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 
1139 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 
1152 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.78 
 
 
1112 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 
876 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.93 
 
 
1031 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1739  SNF2-related protein  23.68 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.38 
 
 
1089 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  22.33 
 
 
1110 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  25.39 
 
 
1209 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  24.63 
 
 
1080 aa  80.1  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  24.79 
 
 
1069 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  25 
 
 
902 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  25.53 
 
 
1069 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  23.8 
 
 
1125 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 
933 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 
633 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  22.54 
 
 
1068 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  25.28 
 
 
746 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  24.18 
 
 
1150 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.46 
 
 
1069 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  22.97 
 
 
891 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  24.79 
 
 
1003 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.67 
 
 
925 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  24.45 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 
1091 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  23.11 
 
 
1084 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  25 
 
 
1031 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  23.8 
 
 
1108 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  23.44 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 
982 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  24.4 
 
 
1178 aa  73.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  25.45 
 
 
924 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.49 
 
 
1091 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  25.17 
 
 
821 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3060  helicase domain protein  22.54 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  22.49 
 
 
1090 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.33 
 
 
1034 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  22.2 
 
 
1071 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  22.65 
 
 
991 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  22.08 
 
 
931 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  25.9 
 
 
1048 aa  70.5  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  24.44 
 
 
1159 aa  70.1  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  24.22 
 
 
1163 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  25 
 
 
1007 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.49 
 
 
1110 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>